Η καινοτομία του Επιχειρησιακού Σχεδίου αφορά στη δημιουργία ενός εναλλακτικού πρωτοκόλλου μεταφύτευσης με αυτόματη μηχανή, πρακτική που δεν χρησιμοποιείται καθόλου στην Ελλάδα, αλλά συμβάλει στην αύξηση της αποτελεσματικότητάς της ψευδοσποράς και στον αρτιότερο έλεγχο των ζιζανίων. Καινοτόμο στοιχείο αποτελεί και η ενσωμάτωση των υποπροϊόντων της προηγούμενης καλλιέργειας ρυζιού που αναμένεται να ασκήσει αλληλοπαθητική δράση στη βλάστηση, στον πληθυσμό και στην ανάπτυξη των ζιζανίων.

Επιπλέον προβλέπεται η εφαρμογή καινοτόμου λιπάσματος παραγόμενο από υποπροϊόντα ρυζιού, βασισμένο στις αρχές της κυκλικής οικονομίας. Στη δημιουργία του πρωτοκόλλου θα συνεισφέρει και η πρόγνωση των κυρίων ασθενειών με τη χρήση εξειδικευμένου μετεωρολογικού σταθμού και μοντέλου πρόγνωσης της ασθένειας «Πυρικουλάρια», που δημιουργήθηκαν στον ΕΛΓΟ ΔΗΜΗΤΡΑ. Τέλος, καινοτομία θα αποτελέσει η εκπαίδευση και η επιμόρφωση των αγροτών με την οργάνωση σχολείων αγρού πάνω στα πρωτότυπα συστήματα παραγωγής βιολογικής γεωργίας.